癌变·畸变·突变 ›› 2006, Vol. 18 ›› Issue (4): 302-305.doi: 10.3969/j.issn.1004-616x.2006.04.013
安社娟1,3;陈家2;陈华洁1;常 薇1;刘莉莉2;赵艳丰2;陈学敏1
AN She-juan1,3, CHEN Jia-kun2,, CHEN Hua-jie1, CHANG Wei1,LIU Li-li2, ZHAO Yan-feng2, CHEN Xue-min1
摘要: 背景与目的: 在前期研究中发现,16HBE-C细胞表达变化的基因中有未知基因参与,因其与BPDE有关,所以命名为brg(anti-BPDE related gene)基因。本研究应用cDNA末端快速扩增法(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增此未知基因的全长,以进行下一步的基因功能研究。 材料与方法: 应用cDNA末端快速扩增法(RACE技术),对3'和5'端分别设计了梯度PCR,巢式PCR等优化程序,以获得特异的产物,然后对特异产物直接测序,将测序结果进行生物信息学分析,基因拼接等获得新基因brg全长。 结果: 3'和5'端均成功获得特异性产物,3'RACE测序为394 bp,有明显的PolyA加尾信号,有编码区的终止密码子;5'RACE测序为1 017 bp,有起始密码子ATG,其中197 bp为3'和5'全长共有序列。将3'和5'序列拼接,结果全长1 214 bp,生物信息学分析brg基因阅读框1 032 bp,编码344个氨基酸。 结论: 所得结果与设计一致,说明所采用的技术路线是简便可行的,brg基因可能在反式二羟环氧苯并(a)芘的致癌机制中起重要作用。
中图分类号: