建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展

doi:10.3969/j.issn.1004-616x.2009.02.018

癌变·畸变·突变 ›› 2009, Vol. 21 ›› Issue (2): 153-155.doi: 10.3969/j.issn.1004-616x.2009.02.018

建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展

张海峰1,吴炳礼1,方国强1,杜则澎2,黄　俏1(综述),许丽艳2,李恩民1(审校)

1.汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室；2.汕头大学医学院肿瘤病理研究室，广东　汕头　515041

收稿日期:2008-12-17 修回日期:2009-01-12 出版日期:2009-03-30 发布日期:2009-03-30

Received:2008-12-17 Revised:2009-01-12 Online:2009-03-30 Published:2009-03-30

摘要/Abstract

摘要： microRNA(miRNA)是一类长度约22个核苷酸(nt)的非编码单链小RNA分子。近年来，大量的研究证明，miRNA参与了许多重要的生物学过程，其异常表达在肿瘤的发生发展中扮演着癌基因或抑癌基因的角色。关于与肿瘤相关miRNA的实验研究方案通常包括4个步骤:①通过基因芯片技术对癌组织与配对的正常组织中差异表达的miRNA进行筛查，确定候选miRNA；②通过生物信息学软件对所获差异表达的miRNA进行靶基因预测，为后续鉴定差异表达miRNA的靶基因提供线索；③通过RISC免疫共沉淀、稳定同位素标记蛋白质谱或miRNA_mRNA复合物分析等实验方法对miRNA的靶基因进行实验室鉴定；④分析差异表达的miRNA及其靶基因与病理、肿瘤复发转移情况以及生存期等临床指标之间的相关关系，确定miRNA的肿瘤生物学意义。在本文中，结合我们实验室最近利用基因芯片技术研究食管癌中差异表达miRNA及其靶基因的实验结果，综述了目前miRNA及其靶基因鉴定方面的最新研究进展。

张海峰, 吴炳礼, 方国强, 杜则澎, 黄　俏(综述), 许丽艳, 李恩民(审校). 建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展[J]. 癌变·畸变·突变, 2009, 21(2): 153-155.

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